党校在职研究生和其他一般的在职研究生的区别主要是招生对象的不同，教学侧重点不同以及学生的毕业方式不同。
首先，教学对象不同，党校同时作为国家重要的职能部门，社会学科的科研机构，它的招生对象主要包括工作于行业行政机关、国有企事业单位、军队和武警系统系统的副县级以上干部，以及有工作于新闻、出版、政策法规部门，有中、高级职称的党员、预备党员。
党校在职研究生教学侧重点不同，党校是我国最高政治学府，教学更加侧重于政治类、哲学以及其他社会学科，例如马克思主义哲学、世界经济学、法学，这些都是我国高水平的学术学科。
与一般的在职研究生毕业方式不同，党校在职研究生教育仅仅属于学历教育，党校毕业后可以拿到单独的党校研究生学历，不像常规的在职研究生毕业后可以单独拿到学硕学位证或者“非全日制研究生学历”和专硕学位证。在职人员凭借学历证书在企事业单位评职称、职位晋升等用途。
党校在职研究生：有学历无学位，学的知识有限，含金量低、只在内部承认。但不用考英语就能入学，入学难度低，学费低。
普通在职研究生：有学历也有学校，学的知识范围大，社会认可度高。但是入学标准高要通过相关的考试，学费较高。