推选答案对于这个问题实在是比较难以回答，不过依据这些年来的了解可以尽量把自己知道的回答给提问者，忘采纳，有不对的地方望指正。
要说临床药学的话，归根到底是以药学为根本的，华西的蒋学华，王凌老师认为药学知识才是作为临床药师的特色所在，只有在充分掌握药学知识的前提下才能更好地与医学融会贯通。当然作为一名合格的临床药师也得很好地掌握医学知识，只有这样才能往优秀进发。北医三院的翟所迪老师认为，医药都不能偏废，虽然要求很高，但是这样才能成为一为真正的临床药师。最近两年临床药学以及临床药师有了较快的发展，认知度较前几年有明显的提高，这都得感谢一大批奋斗在一线的老师以及临床药师们，在他们的努力下才会发展的越来越好，即使道路上曲折的，前途依然光明。
下面说说自己对国内临床药学排名的一些看法：（仅是自己个人结合各方信息的观点）
1.北京大学：卫生部重点学科，其临床药学学科从药理学中脱离出来，有专门的药事管理与临床药学系，其附属医院药学部的老师们对该学科的发展投注了大量的热情与精力，学校有硕士点与博士点，开展得比较早，国际化交流比较多，最新的临床药学专业规划教材有北大老师们的努力，要感谢为临床药学专门编写教材的老师们（以前都没有供临床药学专业用的专门教材，现在刚起步，可能不完美，但大家的努力都看到了，老师们辛苦了！）
2.四川大学：华西药学院属于原来两院三系（南药北药北大华西复旦）中的一个，其药学根底很深厚，华西作为国内最先开设临床药学的学校，实力是毋庸置疑的，蒋学华老师编写的《临床药学导论》算是领大家进门吧，学校很多老师也为教材的编写付出了心血。药学院的可能偏重理论，做药代动力学这些多一点，张伶俐等附属医院的应用方面可能多一点。不过中间停过一段时间没有开设临床药学，算是有停滞不前吧，2011级没有临床药学，只有药学，2012级又有临床药学了，还希望零头羊们要一直大力发展。
3.复旦大学/北京协和医院：之所以把协和医院放在第三位，主要是由于协和自身没有本科，但是其临床药学发展却相当前沿，作为国内的医学圣地，各学科发展几乎都是国内排头兵，限制的是每年招收的硕士比较少，也算是精英模式吧。朱珠老师与中国医科大学的唐漫老师编写的《临床药学英语》里面很多都是国外最真切的临床药学相关资料，在美国待了十几年的唐漫老师带回了大量国外临床药师工作情况的珍贵视频，朱珠老师们为大家提供了一个国际化的视野，这也有利于临床药学的发展，学习别人的有点，结合自身情况进行改进才能长足进步。至于复旦药学也是相当强大，本来底蕴深厚，依托张江大量的药企，且在上海，人均收入较高，思想开化，对药学服务要求相对高一些，对于临床药学和临床药师的接受程度也较好，学校有临床药学的刊物出版，在这方面属于国内做得领先的，有助于临床药学的交流与进步。
4.中国医科大学：就药学整体的发展来看，其实力确实不及两院三系，现在的北药以前是中国医科大学的药学院，其分出确实使学校元气大伤，但在当时为了祖国的建设也是有不可磨灭的贡献。现在重建的药学院，依托医学的强大支撑以及几个附属医院的大力支持举全药学院之力从临床药学进行突破，确实是取得了不俗的成绩，单就临床药学这个学科来看能够排到这个位置。唐漫老师参编的临床药学英语，以及药学院魏敏杰院长编写的临床药理学都很好。可能是老师学生都有一种争做第一的精气神，培养的学生很不错，每年都很多到协和，北大，复旦，华西的学生（学校没有临床药学硕士点比较吃亏，算是为别人培养啦，就本科性价比而言还是非常不错）。其附属医院是临床药师培训基地，每年都培养了很多优秀的临床药师。学校在临床药学这方面走在国内前沿，武书连连续几年将中国医科大学的临床药学排在第一，多有不实，但排在前几名肯定是毋庸置疑的。
5.山东大学：山东大学有临床药学的本硕连读，七年的学制算是开国内之先河了，齐鲁大地孔子故里确实也是文化底蕴不错，但药学比起上面的稍逊，有其毕业的学长称学校附属医院没有收本校的学生，可能影响因素是多种多样与学生也有关，但是也可推测该专业在济南开展得并不顺利，还得多多努力。
6.中南大学：湘雅的临床药学有精品课程，在我国中部算是发展的不错的，楚湘这片地方关于改近的风气一直很浓厚，无论是领导人从这里出来，还是湖南卫视等等，所以有敢为人先的勇气，而学科的发展确实需要大批有勇气与恒心之人，耐得住寂寞与不解。
7.哈尔滨医科大学：学校位于有东方莫斯科之称的哈尔滨，中国医科大学以前的一二分校与当地的学校合并组建而成（细细看来中国医科大学确实为祖国的医学输血很多啊，难怪现在实力比之以前要弱上几分）可能是有医学及附属医院的支撑发展的也不错，老师们致力于临床药学的发展，积极参与临床药学专业系列教材的编写。
8.中国药科大学：简称南药，药学整体实力强大，有药学界的清华之称，不足之处在于缺乏医学支持，也没有附属医院进行教学，虽然与其他医院合作，但多少有瑕疵，整体偏向于药，对于医学知识的缺乏为之后的发展有所限制，本校学生做医药代表的较多，既懂医又懂药确实优势明显，本校生戏称为中国药代大学。
9.沈阳药科大学：简称北药，总体情况跟南药类似，药学整体很强，特别是药剂学更是相当厉害，但临床药学发展就相对受限，好像是与沈阳202医院合作，有点记不清楚了，总之想学临床药学的话还是要找有附属医院的医科大学比较好，医与药知识才会融会贯通。
10.中山大学
11.浙江大学
12.华中科技大学
13.首都医科大学
14.重庆医科大学
15.福建医科大学
16.安徽医科大学
17.大连医科大学
18.南方医科大学
19.第二军医大学
20.广东药学院