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电影一共出了12部
以下是电影（剧场版）简介
1：引爆摩天楼(1997)
柯南的第一部剧场版《引爆摩天大楼》九七年七月十九日在日本公映 英文名：A Clockwork SKyscraper
这无疑是上映的三部中最出色的一部，讲述的是一个绝对对称完美主义的建筑师利用频频发生的爆炸案对柯南发起的极限挑战的故事。这是一部制作得极其精良的作品，从故事情节上来说，并不是一个简单的杀人事件，而更像是美版的"虎胆龙威"以及"007"系列的综合版。在频频发生的爆炸案要求柯南必须在瞬间做出果断的抉择，同时还要时刻警惕罪犯向下一个目标发起攻击，此外柯南还必须发挥他的超级推理能力，将隐身于幕后的黑手绳之以法。全剧的推理性并不强，凶手几乎是显而易见的，它的胜利在于惊心动魄高潮迭荡的故事情节和气势宏大又充满真实感的火爆场景，当然新一和小兰之间的真情流露也是另一个不容忽视的卖点。剧中制作人员非常注重场景的真实性的表现的。高耸入云的米花大厦，气势恢宏的铁路大桥以及复古风格的儿童公园都显得是那样的美丽真实，给人一种身临其境之感。而频频出现的逼真爆破场面，更是锦上添花。而结尾处，那根连系着新一和小兰的拯救世人命运的红线触动了多少人的心啊！
主要内容
某天，柯南在整理信件时，发现了一封寄给自己的信，原来是有名的建筑师－－森谷帝二邀请新一去参加他举办的茶会。没办法以新一身份去参加的柯南，打电话要小兰等人代替他去，但小兰开出另一个条件，要新一和她在5月3日晚上十点一起去看电影。原来5月4日那天是自己的生日啊！柯南都把这件事给忘了。在茶会上小兰和森谷帝二谈起要和新一约会的事。
到了5月3日当天下午，小兰便出门了。柯南在无可奈何之际，看见新闻说火药库的火药被窃，而且最近发生了许多纵火事件，似乎都出自同一人之手；而后这个犯人打电话给新一，声称手里有炸弹，要新一马上到堤向津川绿地公园，不然就会有人死。柯南用划板迅速赶往公园，发现侦探团的孩子正在玩一架来由不明的轰炸机。虽然柯南击毁了飞机，但还是发生了爆炸。
这时罪犯又来电话，说3点在米花车站广场会有炸弹爆炸，提示是在树下。柯南来到车站，发现原来炸弹是放在一个装猫的宠物篮内，因为日语树根和猫同音，但篮子被人拿走了。柯南好不容易才追到篮子，可只剩20秒了，这时记时器突然停了，但柯南刚把炸弹带走一会儿就又开始跳动。柯南将炸弹带离人群，但炸弹还是爆炸，他也受了伤，进了医院。
在医院里大家怀疑是新一的仇家干的，新一曾破的最有影响的案子是西多摩市的冈本市长开车撞人案，那个市长因为此案而下台，西多摩市的市政建设计划也因此而取消了……不久犯人又来电话，声称在东京都环状线上装了5颗炸弹，在下午4点后，行驶的列车速度不满60公里，或太阳下山了，那么就会爆炸，提示是炸弹在“XX之X”，而侦探团的孩子也在车上。柯南从太阳能想到，炸弹是在“铁轨之上”，但事后发现用去的炸药只是被偷的1/4。
白鸟警官发现几处被破坏的建筑都是森谷帝二30岁前设计的，大家来到森谷帝二家调查，柯南在他家的作品展览室发现了西多摩市的市镇建设计划模型……没多久柯南就使犯人露出了原形。看似结束的事件却尚未结束，犯人说他已把最大的炸弹放置在米花市政厅中了，而且……那不是小兰正处在的地方吗！此时离爆炸时间已所剩不多了……柯南尽全力来到大楼内，用电话联系小兰教她如何拆炸弹。最后，只剩下两条电线，到底应该剪哪条呢？是剪有小兰和新一的幸运色的那条？……此时是5月4日零点！
2：十四番的目标(1998)
柯南的剧场版第二部《十四番的目标》放映于九八年四月十五日 英文名：The Fourteenth Targrt
它讲述了一个因交通意外而失去味觉的调酒师所展开的疯狂报复的故事，此剧秉承了《柯南》系列一贯的作风：变态的犯罪策划者，惊险的爆破场面，以及接连发生的凶杀案。唯一的例外是加入了小兰的父亲毛利小五郎和前妻妃英里的感情纠葛戏。华丽的布景可以说是它最大的卖点，特别是故事的高潮发生地——宏伟而神秘的海上饭店，在制作场景时，制作人员将东京以台场为中心的沿海街区真实的再现于动画中，加之以此真实地点为原型的而构造的海中摩天大厦，效果可以说是异常的浪漫动人。再加上那首由日本著名乐队ZARD演唱并被公认为《柯南》所有剧场版里最动听的主题曲——《仿佛回到少女时代》，以及结尾处小兰和柯南的“意外之吻”，使得此剧在日本上映时，票房超过了10亿元！
主要内容
正在慢跑的目暮警官遭人用十字弓射伤而住院了，就在第二天，小兰的母亲—妃英理吃了被人下毒的巧克力，昏倒在事务所里，紧接著阿笠博士也被歹徒用十字弓射伤，每一个凶案现场都分别留下了有关黑桃扑克牌上K、Q、J上的物 品，三人的名字内都有13、12、11的数字，且被害者都与小五郎有关系。到底这张扑克牌代表著什麼？难道是死亡……
根据线索，目暮警官推断犯人可能是……十年前，扑克牌赌场的经营人村上丈，被当警察的小五郎逮补。侦讯中，村上丈藉口内急而挟持了来找小五郎的英妃理，企图逃走。枪法一流的小五郎第一枪掠过英妃理的腿部，然后再一枪击中村上丈，才结束了这场惊险的事件。之后小五郎引咎辞职了，妃英理也和小五郎分了居。这件事对小兰的打击非常大，她从此对父亲失去了信心。而村上丈在上个礼拜假释出狱了……
怪异的连续袭击事件是按照著扑克牌的顺序进行的，这一次出现的牌面是黑桃十。遭到犯人狙击的是小五郎打高尔夫的球友十弘树。柯南等搭乘十弘树所驾驶的直升机，弘树驾驶前必要点的维他命被人给掉包了，眼睛遇太阳刺眼得张不开，失去了视力，所幸柯南及时降落，逃过了一劫而黑桃十出现在迂弘树家中。凶手的杀机笼罩著所有和小五郎有关的众人……\r
为了名字里有九的旭胜义，大家随泽木公平来到了著名的海上娱乐中心乐乐广场。柯南发现了现场的人们名字中都含有「数字」。难道犯人把所有的猎物都一网打尽吗？在海底餐厅里，他们并没有发现嫌犯--村上丈的踪影，却发现了主人旭胜义留下的纸条。在酒室中泽木公平遭袭。当大家回到餐厅时，却发现了实业家旭胜义的尸体。
被困在大厅里的众人纷纷找寻出口，刹那间灯熄了！名模特儿小山内奈奈的手却发出了闪光，然后惨遭毒手，而在她的尸体旁边有一张黑桃七的扑克牌。此时巨大的爆炸声响起，犯人炸毁的餐厅。大家逃离了海底，正当柯南指正凶手时，凶手捉了小兰当人质，并要柯南将手枪丢给他，一切的景象就跟小五郎当年面对村上挟持妃英理做人质一样……
3：世纪末的魔术师(1999)
《柯南》的剧场版第三部《世纪末的魔术师》九九年四月14日在日本上映 英文名：Last Wizard of the Century
这部无论是从故事情节上还是从场景设置上都恢复了第一部所具有那种高水准，主要内容是围绕着一颗罗马诺夫王朝的皇室秘宝「记忆彩蛋」而展开的。柯南最强的对手－－“怪盗KID”再次登场，而小兰也开始怀疑柯南与新一的关系，名侦探——江户川柯南，终于要面对他生平最大的危机，同时，也是史上最难解的谜团！在制作此剧时，工作人员为了贯彻柯南系列所特有的那种写实场景风格，拍摄了大量的实景照片，取景地点从大阪到横须贺，范围大到豪华客轮小到民宿民宅，连步美所住的那栋豪华住宅，就是取景于青山刚昌本人所居住的高级住宅楼（再一次感叹，日本的漫画家真的都非常非常的有money！）。本片中的登场人物非常之多，几乎柯南系列中的所有人物都出现了，尤其是惯偷KID常常变装，在众人的眼皮下以多种形象出现，但因为故事情节的巧妙编排，所以看起来并无杂乱无章之感，反而显得更加的跌宕起伏，曲折动人。
主要内容
罗马王朝的皇室秘宝－回忆彩蛋，将在大阪铃木财团美术馆内展出的同时，怪盗KID寄出「犯案预告信」准备夺取这无价的皇家艺术之宝，于是铃木会长要求小五郎协助警方侦查，以防彩蛋被窃取。柯南一行人来到大阪，遇到服部平次，便一同侦查此案。在美术馆遇到了苏联大使馆的书记、珠宝美术商、罗马王朝研究家、职业摄影师等人。
看完彩蛋，大家便解读预告信线索，不料将时间、地点都解读错误。而KID窃听到彩蛋被转移了。在疏于防备的情况下，KID 成功地找到了回忆彩蛋。虽然柯南已经发现了KID的行动，看还是晚了一步。KID在逃离途中，却被神秘的杀手狙击，坠海失踪，生死不明。 柯南以新型滑板追踪，夺回彩蛋。与此同时从国外回来的香阪夏美小姐，从祖母的遗物中发现彩蛋的原稿图与实物不同。
柯南看了原稿后，认为彩蛋有两颗，而在彩蛋的玻璃上映照出夏美曾祖父所盖的城堡，所以大伙儿及对彩蛋虎视眈眈的研究者决议要去此城探索 ，找寻第二颗彩蛋。在返回东京的船上，摄影师寒川被杀，而且和KID相同是被击中右眼。木暮带着白鸟赶到，调查后柯南发现凶手可能是职业杀手史考兵。而白鸟却几次揭穿柯南的提示，使小兰对柯南的身份起了怀疑。
到达东京后，大家前往城堡，阿笠博士为了送做给柯南强化的眼镜，与灰原哀 也一同出发至城堡，不料少年侦探团也藏身在车上跟踪而行。在城堡中，柯南意外发现通往地下室的通道，在秘道中珠宝商干被杀。而其他人在一个棺木中发现了第二个蛋，并明白了回忆之卵的真正含义。
但专门狙击人右眼的神秘杀手「史考兵」也在人群之中…… 他再次行动，目标是小五郎和小兰，刺杀失败后凶手抢走了彩蛋，并想烧毁城堡。柯南追赶凶手，在熊熊大火中，凶手露出了她的真面目……柯南在白鸟的帮助下逃出了火海。回家后小兰对柯南(新一)的真实身份再次起了疑问，正当柯南要说出真相时，新一出现了……
4：瞳孔中的暗杀者(2000)
《柯南》的剧场版第四部《瞳孔中的暗杀者》二○○○年四月12日在日本上映 英文名：Captured In Her Eyes
这部我认为是已排的四部中最具悬念的一部，剧中小兰身处案发现场，由于种种原因而失忆了。但是因为连续杀人犯在开枪时，被小兰看到了他的模样，而小兰即遭到了随时被狙击的命运！同时这件杀人案又有可能牵连警察内部，平时值得信任的刑警也被当作了嫌犯。为了唤起小兰的记忆最好的方法就是让他见到新一，但是……柯南又要如何化解这次的危机！究竟犯人是谁？会是普通小娄娄，或是为居高阶级的警察官?
主要内容
一个雨天柯南刚和小兰打晚电话，在回家的路上遇到了步美他们。众人在马路旁看到一个很象刑警的人，可谁知刚走过马路，就看到这位刑警被人枪杀。大家都没看清杀手的样子，唯一了解的是，凶手是个左撇子。几天后，又一名刑警死在一幢大楼的停车场，手上握着一本警用手册。
几天后,在白鸟警官妹妹的订婚PARTY上,毛利一家人及众多警官纷纷到场，连刑事科局长也到了,PARTY上当毛利问起两起凶案时，白鸟对他说:"Need not to know.(你无需知道)(知る必要のたぃ事)"这是警界的隐语，意思是该案与警界人士有关。不久突然停电，在洗手间的小兰和佐藤,摸索间小兰发现并拿出了放在暗处的手电，枪声响起，佐藤中枪，小兰失去知觉。
众刑警立刻调查，可在大楼里没有一人身上发现有硝烟反应，而小兰却失忆了。终于木暮说出了原委，原来在一年前的一个凶案中，由于案件与刑事局长儿子有关而未有深查。此案被断为自杀，而被害者的妹妹及一名因此案牺牲的警官的儿子却一直对此事耿耿于怀。最近警方又派当时的几名警官重查此案，但调查的三个人却接连遭袭。
柯南记起当天在PARTY确实有几个可疑人物，并推测小兰可能看到了凶手的样子。不久失忆的小兰出了院。虽然警方已派人日夜保护，但小兰还是差点被火车撞到，多亏了柯南才捡回一命。为了保护小兰，柯南开始调查，在与几位当事人接触后，柯南发现了一连串线索，并揭开了无硝烟反应的开枪方法。
同时小兰记起曾经去过的热带乐园，为了不让柯南担心，小兰与小五郎等人偷偷的去了游乐园。在那里少年侦探团制服了一个可疑人物，但真正的凶犯还未出现。晚上，小兰遭到凶手的狙击，而此时柯南还在赶往游乐园的路上。不久两人相遇，在与凶手20分钟的周旋后，凶手终于在柯南的超强球鞋及小兰的空手道的连击下被捕了，小兰恢复了记忆，佐藤警官也恢复了清醒。
5：通往天国的倒计时(2001)
《柯南》第五部剧场版《通往天国的倒计时》于2001/04/11在日本公映 英文名：Count Down To Heaven
《通往天国的倒计时》场景取材开始于永乐町的东京宝冢剧场正在兴建的工地为题材.电梯的缆线断裂的爆破场面、配电室的破坏所引发的停电、切换自己发电等等……壮观场面为创作构想是第5弹的重点。剧场屋顶、观众席上方的兴建工程，地下停车场…等等都是取景的所在地。 这次少年探侦団的戏份很多呦，少年侦探队的大活跃呢! 小小的少年侦探团背负著重大救人的使命，以团队合作来解决危机，势必又是一场冒险患难,吉冈昌仁导演所规划的『新的道具』将会隆重登场。另外，黑暗组织也隆重登场，当然啦，反派就是黑暗组织。请大家拭目以待 。
青山老师将会在原作配合第五弹电影剧情，再次让黑暗组织出场，再让电影剧情衔接。这是继青山老师在漫画中让KID下战帖，帮忙为「世纪末的魔术师」下伏笔之后，第二次帮电影衔接剧情。
终于那些家伙全员出动，看不见出口的杀人游戏，现在，终于开始…… 危险的陷阱让时间陷入停止。 那些黑衣人的背后拥有凶恶的阴谋，这些家伙目的到底为何？？ 而且，灰原哀真正的真面目有是如何呢？雪莉在电话中说：“任务已进行完毕。” 以地面上300公尺的摩天大楼为死亡舞台，魔鬼般的手正在暗处悄悄伸向柯南！……
柯南一行人及高木老弟前往超高层摩天大楼参加落成典礼，另一方面，大概知道叛徒雪莉还活著现身在这典礼上，黑衣组织全员出动，在这典礼上杀害数条人命，同时命令伏特加暗中地进行另一项破坏计画，那就是将这大楼给炸毁,不留活口。在一栋300层的双摩天大楼里，伏特加引爆大楼里的变电器，使得整栋大楼大停电，引起大家的恐慌，纷纷透过空中走廊逃往隔壁大楼避难，唯独小兰困在该大楼而没逃出来，空中走廊被爆炸的威力给炸断，但又必须救出小兰，因此柯南利用他的滑板飞越这天际到爆炸的大楼里，成功地将小兰给救出，但走廊炸断了，滑板也无法让两人成功地飞越这天际，小兰便想到利用蹦极的方法带著柯南从高处往下跳……
6：贝克街的亡灵(2002年)
《柯南》剧场版第六部《贝克街的亡灵》于2002/04/17在日本公映 英文名：The Phatom of Baker Street
贝克街的亡灵在英国的历史上，有着在世界犯罪史上都最付盛名的离奇连续谋杀案，从1888年8月31日到11月9日， 在伦敦街头有5名妓女被杀。虽然警方找到了几名嫌疑犯，但最后还是没有找到决定性的证据。
“贝克街连续杀人案”“开膛手杰克”成为世界犯罪史上永远无法确定的谜题。
东京。米花市。米花某会堂这里正要举行能够刷新世界游戏业界的超级实感次世代游戏－－“考克恩”的发布会。集结现代最高科技制作而成的“考克恩”，是玩家乘坐茧状密闭舱，通过电脑模拟再现历史上事件、以假眠状态挑战该事件的假象实感游戏。被邀请参加发布会的柯南、兰、灰原以及少年侦探团一行，夹杂在同时被邀请而来的政界、财界、艺能界等各界代表的孩子们当中，纷纷乘上“考克恩”。然而，等待着他们的却是毫无征兆的突发事件。 制造“考克恩”的最高担当者坚村被杀害了，与此同时，名为“诺亚方舟”的人工智能入侵了“考克恩”的电脑，中断了一切外部*作。柯南他们被带到了100年前阴暗浓雾重重包围下的伦敦，身处新一无比崇拜的夏洛克.福尔摩斯所生存的那个时代！ 开始暴走的这个游戏向被困在假象世界的50个孩子、以及现实世界当中的客人们发出了宣言： 以解决历史案件为主题的这个游戏中，只要有一个人幸存下来就是你们获得胜利。但是，假如没有人能够幸存，则所有参加的人全部性命难保！” 在此活动中，还邀请了一位世界级的推理作家作为嘉宾，那就是知道柯南真实身份的新一之父－－工藤优作。优作一边努力揭开坚村被害之谜，一边守护着柯南他们。柯南一行也拼命徘徊在北“考克恩”真实再现的19世纪末的伦敦街道上，开始了向夏洛克。福尔摩斯所活跃过的贝克街事件的挑战！ 这是以卷入“虚幻与现实”中的50个孩子的生命为赌注的死亡游戏！在19世纪末，柯南到底遭遇了什么样的事件？！面对层出不穷的诡计，在虚幻与真实相交错的两个世界里，柯南与推理能力凌驾自己之上的父亲分别会展开何种精彩推理……？！
剧场版第六弹的监督表示：发生什么样的事件，追查什么样的线索，采取什么样的行动，小兰与柯南常常都是共同行动的。《名侦探柯南》的原作者青山刚昌先生也说要通过爱情故事来表现，或许可以说，爱情是永恒的主题。因此这个因素是必然会涉及到的。这次的剧场版中小兰与柯南的关系被联系在事件中。这些场面都很精彩，非常值得一看哟！
7：迷宫的十字路(2003)
《柯南》剧场版第七部《迷宫的十字路口》于2003/04/19在日本公映 英文名：Crossroad in the Ancient Capital
《迷宫的十字路口》在东京有个“西国立市”神社，那里有三名可疑男子在密谈。突然有个戴着老翁面具的黑影男人出现，用日本刀和弓箭在瞬间将三人杀害。与此事件同时，大阪，京都也相继发生了杀人事件。
根据搜查的结果，警视厅发布，被杀的5人都是往返东京•大阪•京都三大城市盗窃著名佛像和美术品的盗窃集团成员。他们似乎是以日本历史上最有名的悲剧武将——源义经的故事《义经记》为名，首脑化名“义经”，部下以“弁庆”为首，各自以家将姓名相称。是对盗窃集团怀恨之人所为吗？还是内部分裂而杀人呢？警视厅对犯罪动机也没有掌握有力的线索…… 一方面，小五郎带着柯南，兰，园子到访京都。在由绪的寺院——山王寺的住持告诉他们，8年前国宝级的佛像被盗走了，委托他们解读可以判断佛像藏匿地点的迷样的画像。
柯南从佛像被盗的事情怀疑是盗窃集团所为，事件开始向破解的方向进展。但很快，在他到达义经•弁庆的传说流传的make by whyarmy历史遗迹——最著名的京都五条大桥开始追寻时，有个手持竹刀的男人突然来袭！ 在京都的五条大桥上，高个男子弁庆挥起长刺刀，牛若丸刀直劈而下！在栏杆上瞬间闪过的柯南惊奇的看到那个男子！那个男子竟是与工藤新一并称的西部高中生侦探-服部平次。平次是知道柯南的真实身份就是工藤新一的少数几人之一。他也是为了追寻在大阪发生的盗窃集团成员被杀事件的真相到了京都。总是在较劲的柯南与平次这次为了查出事件的真相而戮力合作。
但是，两人身边有个戴着老翁面具的黑影男人！ 在绵密交织的京都十字路口上，隐藏于历史暗影中的谜团与陷阱向柯南等人袭来！棘手案件与敏锐推理，友情与恋爱……还有全明星队伍的声优阵容！而且柯南的身体终于……？！
8：银翼的魔术师(2004)
《柯南》剧场版第八部《银翼的魔术师》于2004/4/17在日本公映 英文名：Magician the Silver Sky
银翼的魔术师 怪盗基德寄来的预告状，然而，这只不过是事件的序章罢了……
一个女人来到小五郎处，请其帮助看守宝石。这女人名叫牧树里，是代表着日本的女演员。她收到预告称有人将会去夺取她所拥有的宝石“命运的宝石”，而预告者正是怪盗基德。小五郎断言：基德将会在树里担任主角的传统话剧的公演最后一天前来盗宝。于是第二天，柯南，小五郎，小兰还有少年侦探团一起前往传统话剧公演的东京汐留。柯南对小五郎的推理充满疑问，于是自己推理基德的出现。然而，在那里出现的竟是工藤新一！
当然，那个新一决不是真的。但是，要证明那个新一是假的的话，就需要柯南表明自己的身份。基德似乎明白这一点，很大胆的想和小兰在一起。这时，在树里任主角的舞台上上演了《约瑟夫王妃》的一幕。被柯南看出真实身份的基德，如何盗走这蓝色的宝石呢！？然后，对柯南他们更大的考验是？
新楼林立的东京里新焦点？Siosaito（东京内最大规模再开发城市）
那一角？夜晚。某座大楼的屋顶,柯南的面前站着一个身穿制服的警员。除此之外，没有任何人。“让我们结束游戏吧，小偷先生”慢慢转过身来的警员。 「说的也是啊，我也过够了和你玩捉迷藏游戏的日子，侦探先生」一瞬间，脱去变装，在夜空中飘动的纯白色斗篷。对峙中的两人。柯南VS基德。一场宿命对决即将拉开序幕……
9：水平线上的阴谋(2005)
《柯南》剧场版第九部《水平线上的阴谋》于2005/04/09在日本公映 英文名：Strategy above the Depths
《水平线上的阴谋》目前已动员了1700万人前往观看的第九弹将会成为黄金周中最受欢迎的作品。本次最新作的舞台由前一部中的天空移至了大海、让观众欣赏到真正的悬念与震撼的动作场面。这次的看点可是大为活跃的“沉睡小五郎”哦。“失败”的小五郎在柯南与兰的遭遇大危机的时刻，会有怎样的表现呢！？过去的事件也与在海上和陆上发生的2个看似毫无关联的事件错综复杂地纠缠着。 柯南与小五郎2人间也展开了龙争虎斗的推理，第九弹真是部充满悬念的巨作。且第九弹的高潮就在于，它是一部仿效好莱坞电影、拥有豪华场面的动作片。剧中还有柯南（新一）和兰超越时空的2人感情羁绊。这是漫画与TV电视中都看不到的原创故事，只有电影才具有的视觉冲击与享受。
15年前，在北大西洋的海上。货船－第一八代号与巨大的冰山相撞而沉没。船长和一名船员牺牲了。在时间飞快流逝的现代、西多摩市。大财团－八代集团中一名造船设计师开车时突发心脏病、死了。就在半个月之后……航行在太平洋上的一艘豪华游轮Aphrodite号。柯南、兰、小五郎一行人去参加了这艘游轮的处女航。但船上有可疑人物正在暗中行动。随后发生了杀人事件。在无处逃生的海上、就此拉开了恐怖阴谋的序幕。
10: 侦探们的镇魂歌(2006)
《柯南》剧场版第十部《侦探们的镇魂歌》于2006/04/15在日本公映 英文名：The Private Eye's Requiem
2006年，迎来了《名侦探柯南》剧场版放映的第10个年头，秉承着每年一部的传统，小小侦探的电影已经走过了漫长的10年，可柯南还依然是个小正太。
在第10部剧场版《侦探们的镇魂歌》中，柯南他们将遭到前所未有的灾难，服部平次和怪盗KID亦将登场。
因为受到谜一样的男子的委托，小五郎和柯南他们一行人来到了横滨。
可是，不慎落入那个男子设下的圈套，兰和少年侦探团成为了人质。限时12个小时。
如果在12个小时里，无法解开委托的事件的真相，安装在兰他们身上的炸弹就会爆炸。而且，那个男子知道柯南就是工藤新一！
“关西高中生侦探”服部平次和怪盗KID也将登场！！
限定的时间一步步逼近。柯南他们能否解开事件的真相，及时将兰他们平安无事地解救出来！？
那个谜一样的委托人，黑色身影的真面目是......
11：绀碧之棺(2007)
《柯南》剧场版第十一部《绀碧之棺》（又名《蔚蓝的灵柩》）于2007/04/12在日本公映 英文名：Jolly Roger in the Deep Azure
《绀碧之棺》今次的故事就从这神秘的小岛开始，在小五郎的带领下，柯南一行人前往位于太平洋上的小岛“神海岛”上享受愉快的假日，蔚蓝色的大海和无限的自然风光加上自古以来流传的两个“神海岛”传说让这个小岛成为游客成群的度假圣地。兰和园子在“海底宫殿”附近的海域享受有氧潜水，少年侦探团则玩起了神海岛观光课安排的寻宝游戏。然而，觑意于传说中的财宝的宝藏猎人们也潜入了这个迷人的小岛上。兰和园子意外的遭遇到一名被鲨鱼群袭击的宝藏猎人，猎人的死是因为传说中的宝藏吗？急忙赶来的柯南发现了死亡的疑点，并和灰原一起展开了调查。
“神海岛”流传这两个传说，一个是沉入海底的古代遗迹“海底宫殿”，它是沉入神秘岛海域的巨大岩石建筑群，虽然研究者纷至沓来，但始终没有人能解开“海底宫殿”的秘密，另一个传说是300年前活跃在加勒比海的2名女海盗“安妮·邦尼”和“玛莉·雷德”遗留下来的财宝，据说她们乘坐的海盗船遭到英国海军的攻击时，只有她们2人勇敢的战斗。随着调查的深入，迷一般的文字“Jolly Roger”浮出水面，宝藏的秘密近在眼前。然后要接近真相总要经历磨难，柯南他们找到的一部分财宝被谜一样的宝物猎人抢走了，而宝藏猎人的魔手也伸向了兰和园子，他们的目的究竟是什么？隐藏在传说中的真相是什么？隐藏在海底宫殿中的秘密又是什么？超越300年的暗号，柯南一一解明。
12：战栗的乐谱(2008)
《战栗的乐谱》近日，发生了以音乐家为袭击目标的连续杀人事件，被害人均出身于原著名钢琴家领衔的一所音乐学院。柯南等一行人，受到了这位钢琴家的邀请，出席由他出资建造的音乐厅的落成典礼音乐会。音乐会的亮点是巴赫弹奏过的管风琴和世界著名的斯特拉迪瓦里琴的音色，以及拥有超强乐感的天才歌手的歌声。
可是，在音乐会正式举办前，陆续发生了许多可疑的事件。而在音乐会当天，柯南等人所在的音乐会场，突然发生了大爆炸。众人被包围在火海中……