吉安市卫生学校于1958年开始筹办，1959年9月正式招生；1960年10月经江西省卫生厅确认，吉安卫校正式挂牌，1966年更名为井冈山地区卫校；1978年经江西省革命委员会批准，在井冈山卫校的基础上成立江西医学院井冈山分院（1980年更名为江西医学院吉安分院），实行江西医学院吉安分院与井冈山卫校合署办校。此后，吉安卫校先后归属江西医学院吉安分院、井冈山医学高等专科学校、井冈山学院、井冈山大学。2006年7月，吉安卫校划归为井冈山大学继续教育学院管理，与继续教育学院、江西广播电视大学实行“三块牌子，一套班子”的管理体制。
学校设有教务科、学生科、团委、招生就业科四个科室。面向全省招收护理、药剂、检验、农医等专业的学生，现有在校学生5200余人。卫校共享井冈山大学医学院、护理学院的师资与教学资源，现有专兼职教师174人，实验人员32人，其中具有高级职称的60人，中级职称的65人，且多数教师同时从事教学、临床工作，为“双师型”教师。
学校建有设备先进、条件完善的基础实验中心、临床机能训练中心、药学综合实验室、中医药陈列室、解剖标本陈列室等，并建有省内外实习基地64个，三甲附属医院1所。
吉安市卫生学校实行封闭式管理。由专职班主任每天24小时负责管理学生学习及生活等日常事务，班主任与学生同吃同住。江西省吉安市卫生学校授课教师由井冈山大学教授、副教授、讲师、博士及硕士承担，教学与报考执业资格证书接轨。江西省吉安市卫生学校毕业时可取得“三证”。护理专业学生在校第三年即可参加护士资格考试，农村医学专业毕业后可以参加全国助理医师资格证考试，毕业时可取得毕业证、资格证及国家计划内统招的报到证（即原来的派遣证）。
吉安市卫生学校就业率高。吉安市区、县各级医疗单位的医护人员绝大部分为我校毕业生，学校现与上海、深圳、东莞、江苏、浙江等发达地区的近百家医疗单位建立了就业网络，就业率达到较高水平。