福建医科大学比较好的专业有临床医学、口腔医学、药学、护理学、麻醉学、预防医学、临床药学、医学检验技术、康复治疗学、公共事业管理、应用心理学、生物制药、基础医学等。
1、一流本科专业建设点（国家级+省级）
2020年度福建医科大学一流本科专业建设点名单
5个专业入选国家级一流本科专业建设点：麻醉学、预防医学、临床药学、医学检验技术、康复治疗学
3个专业入选省级一流本科专业建设点：应用心理学、生物制药、基础医学
2019年度福建医科大学一流本科专业建设点名单
4个专业入选国家级一流本科专业建设点：临床医学、口腔医学、药学、护理学
3个专业入选省级一流本科专业建设点：麻醉学、预防医学、公共事业管理
2、国家级特色专业
国家特色专业
| 序号 | 高校名称 | 专业名称 | 批次 |
| 1 | 福建医科大学 | 护理学 | 第二批 |
| 2 | 福建医科大学 | 临床医学 | 第三批 |
| 3 | 福建医科大学 | 预防医学 | 第四批 |
| 4 | 福建医科大学 | 药学 | 第六批 |
3、其他重点专业
福建省特色专业：应用心理学、医学检验、社会工作、临床医学、口腔医学、药学、护理学、预防医学校级特色专业：口腔医学、临床医学、麻醉学、药学、医学检验国家级专业综合改革试点：护理学福建省专业综合改革试点：临床医学、药学、预防医学、口腔医学、医学检验、应用心理学
二、福建医科大学招生专业名单| 专业名称 | 开设时间 | 专业名称 | 开设时间 |
| 临床医学 | 1937年 | 临床医学（七年） | 2001年 |
| 临床医学（“5+3”一体化） | 2015年 | 麻醉学 | 1993年 |
| 医学影像学 | 2000年 | ||
| 预防医学 | 1959年 | 公共事业管理 | 2001年 |
| 食品质量与安全 | 2012年 | 卫生检验与检疫 | 2013年 |
| 口腔医学 | 1984年 | ||
| 医学检验技术 | 1984年 | 康复治疗学 | 2002年 |
| 生物医学工程 | 2001年 | 医学影像技术 | 2012年 |
| 医学实验技术 | 2013年 | 眼视光学 | 2015年 |
| 眼视光医学 | 2016年 | ||
| 护理学 | 1993年 | ||
| 药学 | 2000年 | 药物制剂 | 2008年 |
| 临床药学 | 2012年 | 生物制药 | 2012年 |
| 药物分析 | 2014年 | ||
| 社会工作 | 2002年 | 应用心理学 | 2003年 |
| 英语 | 2008年 | ||
| 基础医学 | 2012年 | 生物信息学 | 2013年 |
福建医科大学（Fujian Medical University ），简称福医大，位于东南沿海福建福州，是福建省一流大学和一流学科建设高校、福建省重点建设高校、中国政府奖学金来华留学生接收院校、国家“卓越医生教育培养计划”项目试点高校、国家级大学生创新创业训练计划项目实施学校，是福建省卫生人才培养中心、医学科学研究中心和医疗卫生服务中心。福建医科大学前身是创办于1937年的福建省立医学专科学校，1939年改名为福建省立医学院，1949年改称福建医学院，1969年与福建中医学院、华侨大学医疗系合并，成立福建医科大学。1982年更名为福建医学院，1996年4月更名为福建医科大学。2003年，被福建省人民政府确定为重点建设高校，同年以良好的成绩通过了教育部本科教学工作水平评估。