新疆第二医学院比较好的专业有公共事业管理、药学、医学检验、生物技术。
重点专业：公共事业管理、药学、医学检验、生物技术。
| 临床医学类(本) | 临床医学
麻醉学 |
| 口腔医学类(本) | 口腔医学 |
| 中西医结合类(本) | 中西医临床医学 |
| 药学类(本) | 药学 |
| 医学技术类(本) | 医学检验技术
医学影像技术 卫生检验与检疫 |
| 护理学类(本) | 护理学 |
| 管理科学与工程类(本) | 信息管理与信息系统 |
| 公共管理类(本) | 公共事业管理 |
新疆第二医学院（XinJiang Second Medical college）是一所以医学类为主，理学、管理学等多学科协调发展，公办本科层次医学类普通高等学校。
学院坐落于我国重要的石油石化工业基地——新疆克拉玛依市，定位于应用型高等学校，主要培养区域经济社会发展所需要的高素质应用型、技术技能型人才。