合肥医药类大学排名第一的是安徽医科大学，排名第二的是安徽中医药大学，排名第三的是安徽医科大学临床医学院，以下是相关信息，供大家参考。
| 序号 | 名称 | 主管部门 | 城市 | 公/民 |
| 1 | 安徽医科大学 | 安徽省 | 合肥 | 公办 |
| 2 | 安徽中医药大学 | 安徽省 | 合肥 | 公办 |
| 3 | 安徽医科大学临床医学院 | 安徽省教育厅 | 合肥 | 民办 |
安徽医科大学
安徽医科大学（Anhui Medical University）为安徽省属重点大学，直属安徽省人民政府，由安徽省人民政府、国家卫生和计划生育委员会、中华人民共和国教育部三方共同建设，入选中西部高校基础能力建设工程，成为安徽省高等教育振兴计划第一批“地方特色高水平大学建设”高校，教育部“卓越医生教育培养计划”试点高校。
学校前身是1926年5月创办的上海东南医学院。1949年底响应中共中央华东局“面向农村，走向内地”的号召，内迁安徽省，成为安徽省第一所高等医科院校。1952年改名为安徽医学院。1996年6月经国家教委批准，更名为安徽医科大学。
安徽中医药大学
安徽中医药大学（Anhui University of Chinese Medicine）坐落于安徽省合肥市，入选中西部高校基础能力（二期）建设项目，是安徽省高等教育振兴计划“地方特色高水平大学建设”高校、安徽省高峰学科建设计划支持高校 。
安徽中医药大学创建于1959年，其前身为1952年创立的安徽省中医进修班（学校）。1959年，安徽省政府正式批准成立安徽中医学院。1970年，安徽中医学院并入安徽医学院。1975年，国家教育部批准恢复安徽中医学院。2000年，安徽省医药学校并入安徽中医学院。2011年，省政府批准在安徽中医学院的基础上组建成立安徽省中医药科学院。2013年，教育部同意安徽中医学院更名为安徽中医药大学。
安徽医科大学临床医学院
安徽医科大学临床医学院是2003年由安徽医科大学创建，是经国家教育部和安徽省人民政府批准设立的独立学院；是安徽省纳入第二批本科录取的全日制普通高等教育本科院校。
学院秉承安徽医科大学90余年的文化传统和办学理念，坚持“以教学为中心，以学生为主体”的办学宗旨，坚持“需求导向、错位争先、医教协同、特色发展”的发展思路。2017年11月遵照教育部26号令要求，由安徽医科大学与安徽新华集团投资有限公司合作举办，是按新机制和新模式运行的本科高校。2019年，独立学院转设纳入教育部十三五规划。 2021年3月，学院转设方案经省教育厅上报教育部审批。