新疆第二医学院有临床医学、麻醉学、口腔医学、中西医临床医学、药学、医学检验技术、医学影像技术、卫生检验与检疫、护理学、信息管理与信息系统、公共事业管理等专业，以下是新疆第二医学院专业设置情况，供大家参考。
注：2021年1月25日，教育部同意新疆医科大学厚博学院转设为新疆第二医学院。
新疆第二医学院（XinJiang Second Medical college）是一所以医学类为主，理学、管理学等多学科协调发展，公办本科层次医学类普通高等学校。
学院坐落于我国重要的石油石化工业基地——新疆克拉玛依市，定位于应用型高等学校，主要培养区域经济社会发展所需要的高素质应用型、技术技能型人才。