西南交通大学本科专业有61个：土木工程、建筑学、地质工程、材料科学与工程、制药工程、车辆工程、工程力学、交通运输、测控技术与仪器、测绘工程、计算机科学与技术、交通工程、通信工程、生物医学工程、自动化、环境工程、生物工程、电气工程及其自动化、遥感科学与技术、安全工程专业（交通运输安全与信息技术方向）、国际经济与贸易、数学与应用数学、建筑环境与能源应用工程、电子科学与技术（微电子技术方向）、信息管理与信息系统、能源与动力工程、消防工程、铁道与城市轨道工程、机械设计制造及其自动化、电子信息科学与技术、应用统计学、电气工程及其自动化（电力牵引与传动控制）、应用心理学、软件工程、物流工程专业（四川省品牌专业）、工业工程、电子信息工程、绘画、物流管理专业（物流管理方向）、产品设计、英语、工程管理、物流管理专业（采购与供应管理方向）、日语、电子商务、环境设计、物联网工程、会计学、电气工程及其自动化专业（城轨及磁浮交通电气化方向）、德语、公共事业管理、视觉传达设计、风景园林、法语、工商管理专业（市场营销方向）、金融学、法学、地理信息科学、轨道交通信号与控制、政治学与行政学、城乡规划。
西南交通大学其他专业有2个：翻译、应用物理学。