济宁医学院有临床医学、医学影像学、精神医学、儿科学、口腔医学、预防医学、针灸推拿学、中西医临床医学、法医学、应用心理学等专业，以下是济宁医学院专业设置情况，供大家参考。
| 类别 | 专业名称 | 学制 |
| 夏考本科常规批 | 临床医学 | 五年 |
| 医学影像学 | 五年 | |
| 精神医学 | 五年 | |
| 儿科学 | 五年 | |
| 口腔医学 | 五年 | |
| 预防医学 | 五年 | |
| 针灸推拿学 | 五年 | |
| 中西医临床医学 | 五年 | |
| 法医学 | 五年 | |
| 应用心理学 | 四年 | |
| 制药工程 | 四年 | |
| 食品质量与安全 | 四年 | |
| 生物制药 | 四年 | |
| 医学检验技术 | 四年 | |
| 康复治疗学 | 四年 | |
| 康复工程 | 四年 | |
| 卫生检验与检疫 | 四年 | |
| 护理学 | 四年 | |
| 助产学 | 四年 | |
| 临床药学 | 五年 | |
| 英语 | 四年 | |
| 生物技术 | 四年 | |
| 医学信息工程 | 四年 | |
| 计算机科学与技术 | 四年 | |
| 生物医学工程 | 四年 | |
| 生物工程 | 四年 | |
| 生物信息学 | 四年 | |
| 药学 | 四年 | |
| 药物制剂 | 四年 | |
| 中药学 | 四年 | |
| 信息管理与信息系统 | 四年 | |
| 市场营销 | 四年 | |
| 公共事业管理 | 四年 | |
| 英语（校企合作） | 四年 | |
| 计算机科学与技术（校企合作，含智能AI） | 四年 | |
| 计算机科学与技术（校企合作，含智能物联、健康大数据） | 四年 | |
| 药学（校企合作） | 四年 | |
| 护理学（校企合作） | 四年 | |
| 市场营销（校企合作） | 四年 | |
| 夏考本科提前批 | 临床医学（省属公费医学生） | 五年 |
| 春季高考本科批 | 针灸推拿学 | 五年 |
| 康复治疗学 | 四年 | |
| 对口贯通3+4 | 中药学 | 四年 |
| 市场营销 | 四年 |
济宁医学院（Jining Medical University）创建于1952年，是一所以医学教育为主体，医、理、工、管、文等多学科发展的山东省属高等医学院校，入选国家首批卓越医生教育培养计划、双万计划、教育部地方高校第一批本科专业综合改革试点项目、国家级特色专业建设点、山东省卓越工程师教育培养计划、山东省应用型人才培养专业发展支持计划、山东省首批公费医学生试点高校、山东省省级硕士立项建设单位。中华医学会行为医学分会和山东省行为医学委员会挂靠学校，是精神病学与精神卫生专业国内本科办学最早、招生规模最大的高等院校之一。
学校前身是山东医学院附设医士班，1952年迁往济宁戴庄筹建山东省济宁医士学校， 1958年更名济宁医学院，招收第一届本科生；1959年更名济宁医学专科学校； 1987年重新更名为济宁医学院。