集美大学本科专业有60个：通信工程、车辆工程、国际经济与贸易、旅游管理、计算机科学与技术、软件工程、工程管理、财政学、建筑环境与设备工程、金融学、电子商务、机械工程及自动化、环境工程、经济学、物流工程、法学、投资学、轮机工程、电气工程及自动化、电气工程及其自动化、社会工作、信息管理与信息系统、交通运输、网络工程、动物科学、法学、航海技术、市场营销、水产养殖学、食品科学与工程、运动训练、机械电子工程、海洋渔业科学与技术、生物工程、民族传统体育、土木工程、会计学、机械设计制造及其自动化、社会体育、船舶与海洋工程、工商管理、体育教育、热能与动力工程、物流管理、电子信息工程、自动化、教育技术学、音乐学、小学教育、动植物检疫、光信息科学与技术、英语、信息与计算科学、日语、对外汉语、数学与应用数学、应用物理学、地理信息系统、应用心理学、汉语言文学。
集美大学其他专业有4个：电子科学与技术、资源环境与城乡规划管理、材料成型及控制工程、工商管理。