福建农林大学本科专业有82个：车辆工程、电子信息工程、食品质量与安全、计算机科学与技术、食品科学与工程、木材科学与工程、材料科学与工程、森林工程、网络工程、电气工程与自动化、电子科学与技术、环境工程、环境生态类（中外合作办学）、城市规划、交通工程、微生物学、土木工程、植物保护、交通运输、林学、化学工程与工艺、风景园林、制药工程、森林资源与保护游憩、生物工程、园林、交通运输、软件工程、电气信息、机械、水土保持与荒漠化防治、电气工程及其自动化、轻化工程、机械设计制造及其自动化、农业资源与环境、水产养殖学、人力资源管理、土地资源管理、生物技术、动物科学、植物生产类（中外合作办学）、统计学、行政管理、文化产业管理、金融学、农林经济管理、国际经济与贸易、信息与计算科学、动物医学、会计学、法学、经济学、植物生产类（中外）、资源环境与城乡规划管理、工程管理、数学与应用数学、环境生态类（中外）、电子信息科学与技术、工业工程、农学、经济学、工商管理、生态学、公共管理、蜂学、物流管理、数学、生物信息学、园艺、公共事业管理、农村区域发展、茶学、劳动与社会保障、生物科学、工商管理、生物安全、设施农业科学与工程、生物学基地班、旅游管理、英语、生物科学、广告学。
福建农林大学其他专业有6个：空间信息与数字技术、种子科学与工程、森林资源保护与游憩、中药资源与开发、应用化学、新能源科学与工程。