南阳理工学院本科专业有53个:生物工程、网络系统管理、机械设计制造及其自动化、精细化学品生产技术、电子信息工程、食品生物技术、计算机科学与技术、综合文科教育、营销与策划、英语教育、电脑艺术设计、模具设计与制造、计算机应用技术、数控技术、建筑学、高级护理、计算机信息管理、土木工程、中医学、动漫设计与制作、护理学、测控技术与仪器、软件技术、自动化、化学工程与工艺、食品科学与工程、计算机网络技术、软件工程、电气工程及其自动化、会计学、英语、通信工程、艺术设计、电子商务、城市规划、音乐表演、工程管理、汉语言、工商管理、网络工程、日语、给水排水工程、电子科学与技术、市场营销、国际经济与贸易、法学、财务管理、工商管理类(中外)、幼儿教育、数学与应用数学、工商管理、计算机科学与技术系、汉语言文学。
南阳理工学院其他专业有8个:小学教育、统计学、材料成型及控制工程、道路桥梁与渡河工程、汽车服务工程、应用化学、中药学、学前教育。