学校执行教育部规定的“学校负责，招办监督”的录取体制，招生录取工作统一通过省教育考试院网上系统进行。学校严格按照教育厅制定的有关政策以及本章程，坚持公平、公正、公开的招生录取原则。
学校按省教育厅投档规则接收考生电子档案，按规定进行审阅，符合要求者予以录取，不符合者予以退档,未录满的专业将按规定征集志愿。凡考生未按本章程第九条规定选报对应本科专业者，学校有权不予录取。
脱贫家庭(原建档立卡贫困家庭)考生、获奖考生(含高水平运动员)录取实行计划单列政策。退役大学生士兵申请免试录取的，按《江西中医药大学2022年退役大学生士兵专升本免试录取办法》执行。
凡符合录取条件的考生，不得要求学校退档。对符合录取条件的考生，学校不以考生自愿放弃为由退档。
根据教育部、卫生部颁布的《普通高等学校招生体检工作指导意见》，按照专业培养要求和就业行业特点，本着对考生负责、维护考生利益的原则，学校医药类专业不予录取有色盲、色弱及其他各类不能准确识别颜色的考生。考生有严重视力、听力障碍或患斜视、嗅觉迟钝、口吃者，不宜填报医药类专业。
学校按规定向社会公布录取结果，考生可登录学校招生信息网查询。学校以特快专递的方式向已录取的考生寄发由校长签发的录取通知书。