山西医科大学的前身是山西医学传习所，创建于1919年。学校多次易名，数次迁址。1932年1月，改为私立山西川至医学专科学校。1940年3月，更名为山西大学医学专修科。1946年8月，升格为国立山西大学医学院。新中国成立后，学校步入了一个崭新的发展时期。1953年9月,独立建校，更名为山西医学院。1955年全国高校院系调整时，山西、江苏、山东、浙江四所医学院的卫生系合并组建了山西医学院卫生系，成为全国保留有卫生系的六所高等医学院校之一，并由全国著名卫生学专家、国家一级教授、原江苏医学院院长邵象伊担任院长。1996年9月，更名为山西医科大学。
学校现有两个校区，占地1422亩，建筑面积55万平方米；固定资产总值10.8亿元，其中教学科研仪器设备值3.1亿元；纸质图书141万册。位于山西省太原市中心的老校区以科学研究和研究生教育教学为主，主要承载部分医学类专业本科生后期教育教学、医学类研究生教育教学、部分科学研究、继续教育和职业技术教育、社会服务和与之配套的管理和部分服务功能。位于山西省晋中市山西省高校新校区内的新校区以本科生教育教学为主，主要承载部分医学类专业本科生前期教育教学、非医学类专业本科生教育教学、部分科学研究、留学生教育教学和与之配套的管理和服务功能。
学校现有教职工医护人员6000余人，教师1590人，研究生导师1226人。现有享受政府特殊津贴人员125名，国家级有突出贡献专家2名；国家级教学名师1名，省级教学名师29名，省级研究生教育优秀指导教师17名；教育部新世纪优秀人才5名，“新世纪百千万人才工程”国家级人选2名，山西省学术技术带头人92名，山西省海外高层次人才“百人计划”入选者16名，山西省高等学校优秀青年学术带头人37名，山西省高等学校中青年拔尖创新人才7名；国家优秀教学团队1个，山西省优秀教学团队1个，山西省研究生教育优秀指导教师团队4个；山西省科技创新团队6个，山西省高等学校优秀创新团队2个、山西省高等学校优秀创新团队重点培育对象1个；中央联系的高级专家5名，省委联系的高级专家48名。一批教师荣获全国或全省的模范教师、五一劳动奖章等荣誉称号；一批教师在全国和全省的教师教学基本功竞赛及各类科技奖励中获奖。
学校生源来自全国各省、市、自治区，现有在校生24815人，其中普通本科生15160人，硕士研究生3530人，博士研究生273人，成人本专科生5852人。建校以来，学校培养了以全国首枚“白求恩奖章”获得者、“人民的好医生”赵雪芳、中国工程院院士徐建国为代表的医药卫生专业人才近9万名。近年来，学校积极调整人才培养层次结构，不断深化教育教学改革，人才培养质量不断提高；本科毕业生升学率在30%以上，毕业生就业率保持在80%左右。调查显示，用人单位对我校人才培养的满意度在90%以上，对毕业生专业学习能力、工作责任心等综合素质的评价较高。
学校现有第一临床医学院（第一医院）、第二临床医学院（第二医院）、汾阳学院、基础医学院、公共卫生学院、药学院、法医学院、护理学院、研究生学院、人文社会科学学院、管理学院、马克思主义学院、继续教育学院（职业技术学院）、口腔医学系（口腔医院）、儿科医学系、麻醉学系、医学影像学系、外语系、体育教学部、计算机教学部、临床技能教学模拟医院21个直属学院、系（部），晋祠学院1个独立学院，上海东方临床医学院和检验学系合作共建院系2个。现有3所直属附属医院，其中，第一医院、第二医院是山西省规模最大的综合性三级甲等医院、全国百姓放心医院，技术力量雄厚，医疗水平领先；口腔医院是省内唯一一所三级口腔专科医院，拥有一批先进医疗设备。另有18所非直属附属医院，32个教学医院，88个其它教学基地，15个研究生培养基地，2个科学研究基地。
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