安徽医科大学临床医学院简称“安医大临床医学院”，创建于2003年是经国家教育部和安徽省人民政府批准设立的独立学院。学院由省属重点大学——安徽医科大学举办，安徽医科大学第一附属医院投资合作办学，是按新机制和新模式运行的全日制本科普通高校。
安徽医科大学临床医学院规划面积378.5亩，有在校学生5000余人 ，设计规模满足4500名研究生、本科生学习、生活基本要求及教学、科研需求，同时配套同步建设1000张病床的安徽医科大学第二附属医院。
院系设置
临床医学院自2005年招生的本科专业为临床医学、药学、公共事业管理（卫生事业管理）、护理学，这四个专业都是具有良好发展前景，适应社会需求的传统专业《临床医学院现设本科专业(方向）:临床医学、药学（临床药理）、药学（药物分析）、公共事业管理（卫生事业管理）、护理学，这五个专业（方向）》。学生学完规定课程和实践、实习内容，经考核合格准予毕业，发放由教育部注册的安徽医科大学临床医学院毕业证书，自2008年入学学生毕业符合学位授予条件可申请安徽医科大学临床医学院的学士学位证书。
本科专业
| 工学 | 生物医学工程 |
| 医学 | 临床医学、药学、护理学 |
| 管理学 | 公共事业管理 |
师资力量
临床医学院依托安徽医科大学的师资力量和办学资源（以下参考安徽医科大学）。
截至4月，该校共有在职教职工3733人，专任教师队伍中具有博士、硕士学位的教师占88.72%，博士生导师178人，硕士生导师1356人。
有国家“百千万人才工程”，“新世纪优秀人才”，教育部骨干教师，卫生部、人事部突出贡献中青年专家，全国首批青年拔尖人才，“百人计划”，“皖江学者”特聘教授，高校领军人才等30人次。
有16人次在国际学术组织和SCI源期刊任职，6人次担任国家“十一五”、“十二五”规划教材主编。3人担任国家级专科学会主委，1人在亚洲学术组织担任主席，9人入选教育部高校医药学科指导委员会专家。10多人获得全国、全省模范教师、优秀教师光荣称号。
有1个高校高端人才引进团队，1个教育部科技创新团队，2个安徽省科技创新团队，3个安徽省“115”科技产业创新团队。1名教授入选“万人计划”第一批教学名师。
教育部科技创新团队：皮肤病遗传学创新团队
安徽省科技创新团队：中药抗炎免疫药理学科技创新团队、皮肤病的遗传学研究团队
安徽省“115”产业创新团队：肝硬化食管静脉曲张出血防治技术应用与开发创新团队、抗炎免疫药物的基础与应用研究创新团队、造血干细胞移植创新团队
教学单位
该院设有基础医学院、护理学院、卫生管理学院、第一临床学院（第一附属医院）、第二临床学院（第二附属医院）、巢湖临床学院（附属巢湖医院）、第四临床学院（第四附属医院）等教学机构。