齐鲁医药学院前身是由万杰集团1995年投资举办的民办山东万杰医学院，1999年经国家教育部正式批准为具有学历教育资格的民办普通高等院校——民办山东万杰医学高等专科学校。2008年4月经国家教育部批准升格为全日制普通本科高校——山东万杰医学院。2008年12月，经中国证监会许可，山东省商业集团有限公司(鲁商集团)重组万杰集团下属的山东万杰高科技有限公司，山东万杰医学院正式由鲁商集团接管。学院举办者变更为鲁商集团，学校由民企办学转变为国企办学。2012年6月经山东省人民政府学位委员会评审，学校建设成为学士学位授予单位，现可授予医学、理学、工学、经济学、管理学学士学位。4月，学校更名为齐鲁医药学院。
学校现设有临床医学、医学影像学、护理学等31个本、专科专业，其中本科专业20个，全日制本专科在校生1.3万余人，教职工近900人，固定资产9.7亿元，教学仪器设备总值10086万元，馆藏图书110余万册。拥有1所直属附属医院、6所非直属附属医院、6所本科临床教学医院等120余家教学实习医院。
建校以来，学校坚持内涵发展，建成2个省级示范建设专业、2个省级优势特色专业、3个省级特色专业、2个省级教学团队、1个省级重点实验室、1门国家级精品课程、1门国家级精品资源共享课程、14门省级精品课程。2013年药学专业被教育部确定为“本科教学工程”地方高校第一批本科专业综合改革试点专业。成为山东省民办本科特色名校立项建设单位。
学校秉承“允理允能，精益求精”的校训，坚持“施优教服务人民”的办学宗旨，立足山东，面向全国，为现代经济社会发展和医疗卫生事业培养医学专门人才。