四川农业大学王牌专业：茶学、草业科学、农林经济管理、农学、动物医学、动物科学、林学、农业资源与环境、园林、园艺学。
根据2019年全国第四轮学科评估结果综合计分，学校在全国农林高校、在川高校中分别位居第7、第4。
从2015年起，农业科学、植物学与动物学2个学科ESI排名持续稳定保持世界前1%。
2019年动物营养与饲养科学、2019年作物学入选全国高等院校学科创新引智计划（111计划）。
国家级特色专业（10个）：茶学、草业科学、农林经济管理、农学、动物医学、动物科学、林学、农业资源与环境、园林、园艺学。
国家级重点学科：动物营养与饲料科学、作物遗传育种
国家重点（培育）学科：动物遗传育种与繁殖、预防兽医学
农业部重点学科：作物遗传育种
林业局重点学科：森林培育
四川省重点学科（一级学科）：作物学、畜牧学、兽医学
世界一流学科：作物学