昭通卫校创建于1957年，是省部级重点中专，也是全省最早的一所地州级中等卫生学校，至今已有62年办学历史，为滇东北卫生事业培养了2万多名医务人员。截至今年11月，昭通卫校现有在校生4549人，其中中专层次学生2895人，专科层次1654人（与大理大学、云南开放大学、曲靖医专、楚雄医专等联办），另有成人教育3500人，毕业生就业率达95%以上。
2010年2月，昭通市委、市政府作出逐步推进昭通职教中心建设的战略抉择；2013年12月，市委、市政府作出修建昭通卫生职业学院的重大抉择，之后昭通各方努力配合、积极申请。
2015年11月30日，云南省教育厅批准我市筹建昭通卫生职业学院，明确拟筹建的学校属专科层次的公办高等职业技术学院，筹建期为1年（2015年11月27 日——2016年11月27日）。
2016年4月，教育部发文，同意昭通卫生职业学院备案。
昭通卫生职业学院是经云南省人民政府批准、昭通市人民政府主管、国家教育部备案的从事医学高等职业教育的公办全日制普通高职学院。学院有附属医院1所，教学实习医院27所，开设护理专业、助产专业、康复治疗技术专业、医学检验技术专业、公共卫生管理专业。学院第二期投入建设，含第二教学大楼、第三实验实训大楼、图书馆等，建筑面积31056.1平方米。