生物信息学院成立于 2000 年，围绕健康信息领域开展科学研究、人才培养和“产学研用”地方经济服务。具备医疗仪器、医学信息工程、生物信息领域的本科生和研究生培养能力。所培养人才遍布在科研院所、数字医疗仪器企业、医药卫生机构，具备极高的美誉度和影响力。以健康信息为特色的生物医学工程学科在重庆和西部影响力巨大，在国内具有较高的知名度。
依托“互联网+”、大数据、“健康中国 2030 规划”等重大国家战略，面向智慧医疗、健康信息等产业的高速发展，秉承“创新驱动、精英培养”的理念，以“信息技术+专业”为人才培养优势，以科技创新素质养成为特色，培养信息技术在医疗装备、健康信息、生物大数据等领域中应用的高级专门人才。
学院有极具特色的科研班训练计划和众创空间，鼓励学生参与创新创业及各类科技竞赛，近年来获中国“互联网+”大学生创新创业大赛等奖励国家级 40 余项、省部级100 余项。学院拥有生物医学工程和生物学硕士授权点，同时在兄弟学院联合招收培养信息类学科研究生，与美国乔治·华盛顿大学合作开展 3+2 模式数据科学专业(MS in Data Science)硕士研究生培养项目。学院现有教师 53 人，专任教师 43 人。正高级职称 14 人，副高级 17 人，博士 34 人。兼职教授 2 名。博士/硕士研究生导师 32 人，省(部)级人才 6 人，人才队伍国际化和区域影响力居学校第一。北京大学原校长许智宏院士、乔治·华盛顿大学曾辰教授等一批著名专家为学院特聘或外聘教授。
学院建有重庆市医用电子与信息技术工程研究中心、重庆市数字医疗装备与系统工程实验室、大数据生物智能重庆市重点实验室，与兄弟学院共建重庆市唯一的智慧医疗系统与核心技术创新团队。获得 6 次中央与地方共建实验室建设项目，拥有 2500 多万元教学科研仪器。近年来主持和承担了科研项目 100 多项，发表科研论文 600 余篇，出版学术专著 7 部，获得国家专利 40 多项，国家级奖励 1 项，省部级奖励 5 项。
学院高度重视对外交流，与北京大学、清华大学、中国军事科学院、陆军军医大学，美国马里兰大学、乔治·华盛顿大学、EBI、Nicholls 州立大学、华大基因、重庆西山科技等单位在健康信息领域进行深度科技交流与合作。学院地处鸟语花香，悠远厚重的南部校区;全院师生努力拼搏，奋力建设一流的医用电子与生物信息学科;形成了“健康、和谐、朝气”的学院文化氛围。 专业介绍 083100 生物医学工程
本学科主要包括生物医学信息学、生物医学仪器、系统生物医学、生物医学材料等研究方向：
(1) 生物医学信息学：主要包括生物医学信号处理、生物医学大数据、生物医学图像处理等内容。利用信息科学的理论、技术与手段，获取、分析、处理、挖掘、传输和综合利用医学和生物学数据、信息和知识，幵对生命活动规律进行研究。
(2) 生物医学仪器：主要开展医用电子学研究。围绕临床医学应用和其他生命科学研究需求，特别是在人类疾病的预防、诊断、治疗、监护和康复上，提供新方法、新技术、研制新仪器，重点发展远程医疗相互仪器和可穿戴式设备。
(3) 系统生物医学：主要包括基因组学与蛋白组学、生物系统建模与仿真等内容。整合应用高通量组学技术以及疾病理论建模等现代生物信息技术，以个性化诊疗为目标，应用系统方法，探索建立疾病发生、发展的机理和预防及治疗的全新理论体系。
(4) 生物医学材料：主要包括医用材料的理论设计和性能研究等内容。通过研究医用材料的组成、结构及性能与生物体之间的相互作用，研究具有良好生物相容性和功能适配性的生物医学材料。
本学科的主要学位与专业课程有：现代医学信号处理、高级生物化学、分子生物学、生物信息学、计算分子生物学导论、智能控制理论与技术、嵌入式系统接口设计与应用、现代医学图像处理、数字医学仪器的设计与应用、医学信息系统、脑机接口研究、体域网、分子绅胞生物学、基因组学与蛋白质组学、生物信息学算法、深度学习与人工智能、物联网导论、生物医学工程前沿技术等。