学校前身是创办于1978年的云南省煤炭工业学校，2002年10月，由云南省工程技术学校、云南省煤炭基本建设公司技工学校、云南省广播电视大学煤炭分校合并组建云南能源职业技术学院。 2020年8月，学院入选为国家第二批现代学徒制试点单位。
根据2020年5月学校官网信息显示，学校有三个校区，总占地面积503亩，建筑面积达2.5万平方米，教学仪器设备总值达6400万；设有7个院（系部），开办34个高职专业；有教职工412人，全日制高职在校生6850人
1978年2月16日，云南省革命委员会同意在曲靖地区筹建一所中专性质的煤炭工业技术学校，学校选址在曲靖城郊大坡寺。
1980年9月，学校首批招收80级地下采煤、矿山机电两个专业，四个班共155名学生。
2000年11月16日，云南省煤炭工业学校更名为云南省工程技术学校。
2002年10月17日，云南省工程技术学校、云南广播电视大学煤炭分校、云南省煤炭基本建设公司技工学校合并办学，组建云南能源职业技术学校。
2007年1月，学校通过了教育部进行的高职高专人才培养工作水平评估。
2008年5月21日，云南能源职业技术学院等6所职业院校迁址新建。
2010年1月，被云南省教育厅批准为“省级示范性高职院建设培育单位”。3月3日，云南能源职业技术学校入驻位于曲靖市职教中心的新校园。
2011年1月，通过云南省财政厅、教育厅验收，正式成为“省级示范性高职院建设单位”。
2014年，学校被教育部等六部委主为全国职业教育先进单位。
2015年10月，学校通过云南省教育厅组织的建设验收，初步建成云南省示范性高职院校。
2020年8月，学院入选为国家第二批现代学徒制试点单位。
