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信息学院现有学科覆盖六个一级学科,拥有博士后流动站2个(电子科学与技术、生物医学工程);博士点6个(微电子学与固体电子学、电路与系统、生物医学工程、光学、电磁场与微波技术、物理电子学);硕士点12个(微电子与固体电子学、电路与系统、通信与信息系统、生物医学工程、电磁场与微波技术、光学、无线电物理、原子与分子物理、光学工程、等离子体物理、光电系统及控制技术、物理电子学)。其中国家重点学科3个、上海市重点学科1个。信息学院现有国家重点实验室1个(复旦大学专用集成电路和系统国家重点实验室),教育部重点实验室1个(教育部散射与遥感重点实验室),上海市重点实验室1个(上海市智能信息处理重点实验室)。