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该院现有林业规划设计院、风景园林设计研究院、森林经理研究室、华南植物研究室、岭南园林规划设计研究室、森林生态研究室、热带园林研究中心、经济林研究中心、林木花卉良种繁育中心、林木健康诊所和保护技术研究中心、城市林业研究中心、生物质能研究所、高新技术木质复合材料工程中心以及广东省自然保护区研究中心、广东省低碳经济和应对气候变化研究中心等研发机构，还有广东省木材与木材制品产品质量监督检测站。同时学院建有3个“中央与地方共建高校特色优势学科实验室”：华南森林培育实验室、热带亚热带林业生物技术实验室、木材科学与工程实验室。建有2个省级重点实验室：广东省森林植物种质创新与利用重点实验室、广东省普通高等学校重点实验室----生物质能源重点实验室。目前正积极参与合作筹建“南亚热带生物资源利用与保护国家重点实验室”。 主任：谢正生副教授 副主任：黄少伟教授、曾曙才教授
下设4个教研室：
1、林木育种教研室 主任：黄少伟教授（兼）
2、森林生态教研室 主任：曾曙才教授（兼）
3、森林保护教研室 主任：王军教授
4、森林培育教研室 主任：薛立教授 主任：李敏教授 副主任：冯志坚副教授 许冲勇副教授 杨学成副教授
下设3个教研室
1、树木学教研室 主任：冯志坚副教授（兼）
2、园林教研室 主任：杨学成副教授（兼）
3、城市规划教研室 主任：赵晓铭 高级工程师 主任：李凯夫教授 副主任：李重根副教授 胡传双副教授
下设2教研室：
1、木材科学与工程教研室 主任：胡传双副教授（兼）
2、家具教研室 主任：李重根副教授（兼） 主任：陈世清教授 副主任：甄学宁副教授 丛艳国讲师
下设2个教研室
1、森林经理教研室 主任：陈世清教授（兼）
2、旅游管理教研室 主任：丛艳国讲师（兼） 主任：陈红跃教授 副主任：伍慧雄高级实验师
下设3个实验室
1、林学基础实验室 主任：李奕震副教授
2、园林规划设计实验室 主任：杨学成副教授（兼）
3、木材科学与工程实验室 主任：王晓波实验师
